随着小叶紫檀的越来越少，市场上便出现不少冒充小叶紫檀的现象。
（1）卢氏黑黄檀，产自非洲马达加斯加卢氏黑黄檀是一种容易冒充小叶紫檀的木材，在20世纪90年代进入中国，在（红木）国标中，属黑酸枝木类，市场上把卢氏黑黄檀不规范的称为“大叶紫檀”，因为卢氏黑黄檀和小叶紫檀有太多的相似之处，单靠传统的经验和纯粹木材解剖的理论很难区分，特别是做成家具或工艺品后，稍加上色，即可真假难辨，时至今日，仍然有人持不同看法
（2）胶漆树，又名任嘎漆、红心漆、南洋漆、红木（越南），为漆树科胶漆树属木材，市场上有人称胶漆树为“尼泊尔紫檀”来冒充小叶紫檀，2007年底在广西市场上曾炒到每吨8万元（实际价格每吨万元左右），最后接手者大呼上当，这种木材也有人叫“小红木”
（3）交趾黄檀，因生长环境不同（一般是陡峭的石山上）或外界条件的影响，有少数木材的颜色与小叶紫檀非常相似，而且密度也差不多，木材直径也不是很大，很多人把此类木材叫“海紫檀”，实际上是交趾黄檀，属红酸枝木，20世纪90年代从越南过啦不少，交趾黄檀与小叶紫檀的简易区别：有酸臭味，无荧光反应
（4）印度紫檀，因小叶紫檀仅产于印度，很多非专业人士一听说印度紫檀就以为是小叶紫檀，实际上这两个木种均属于紫檀属，而小叶紫檀属于紫檀木类，印度紫檀属于花梨木类，从质量和颜色非常容易区分